Cria da base do Remo, Jhonnatan chegou ao Náutico em abril de 2018 para ser incorporado ao elenco que disputaria a Série C do Brasileirão vindo da Portuguesa-RJ. Na primeira passagem, o atleta disputou 13 jogos e marcou dois gols. Em 2019, o jogador atuou em apenas uma partida com a camisa do CSA, pela Copa do Brasil, contra o Mixto-MT, quando atuou por 28 minutos.
#AquiÉNáutico %uD83D%uDC2D%uD83C%uDDE6%uD83C%uDDF9 O volante Jhonnatan está de volta! Jogador chega nesta sexta (3) e fará exames médicos para assinar contrato até o final da Série C. As primeiras palavras do atleta no retorno ao Timbu estão no site oficial: https://t.co/EzMHo00FfQ pic.twitter.com/IjfZKYmH0W
%u2014 Náutico (@nauticope) 3 de maio de 2019
Números de Jhonnatan com a camisa do Timbu
13 jogos (7 vitórias // 2 empates // 4 derrotas)
2 gols marcados
4 cartões amarelos
1.093 minutos em campo

